A Škoda átáll a HVO (hidrogénezett növényi olaj) üzemanyag használatára az újonnan gyártott dízel autók első üzemanyag-feltöltésénél és logisztikai flottájának a tankolásánál. A HVO egy bioüzemanyag, amelyet szintetikus dízel helyettesítőként tartanak számon. Hidrogénezési eljárással állítják elő, elsősorban hulladékolajokból, beleértve a használt étolajat, valamint a növényi és állati eredetű zsírokat. A biodízellel ellentétben a HVO üzemanyag előállítása nem igényel mezőgazdasági növényeket. A HVO üzemanyag áttetsző, gyakorlatilag szagtalan, és jelentősen magasabb cetánszámmal rendelkezik, mint a fosszilis dízel (70 az 51-hez képest). Ez javítja a hengerekben az égés hatékonyságát, és hozzájárul a károsanyag-kibocsátás, különösen a lebegő részecskék mennyiségének csökkentéséhez. A HVO üzemanyag tartalmaz ként, se aromás szénhidrogéneket, valamint magas forráspontú szénhidrogéneket sem. Így a használatával mérsékelhető a károsanyag-kibocsátás, és a dízel részecskeszűrők (DPF) regenerálására is ritkábban van szükség.

Régebbi dízelmotorok esetén a HVO üzemanyaggal járva csendesebb és rezonanciamentesebba motorok működése. A HVO üzemanyag szabadon keverhető az ásványi eredetű dízelolajjal. A HVO üzemanyaggal kompatibilis Škoda típusok a gyártó közlése szerint minden a 2022-es modellévtől kezdődően (a 2021-es év 25. naptári hetétől gyártott) dízel autójuk. A HVO-kompatibilis járművek üzemanyagtöltő sapkáján XTL jelzés található, míg a korábbi gyártású típusok kompatibilitását a hivatalos Škoda márkakereskedések igazolhatják.